siRNA 是基因分析和代謝疾病治療的有力工具。 siRNA 可以在非變性雙鏈條件下使用 HPLC 分析，以控制雙鏈體型態和單鏈的總量。 此外，可以在變性條件下研究非雜交的單鏈 RNA。 在這兩種情況下，IP-RP 和 AEX 都是常用的方法。
在本應用文章中，展示了在變性和非變性條件下對雙鏈 siRNA 的分析。 生物惰性層析管柱 YMC-Accura Triart Bio C18 UHPLC 用於 IP-RP 模式，而離子交換樹脂 BioPro IEX QF 層析管柱用於 AEX 模式。
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