應用資料:使用 RP 或 NP 條件對亞磷酰胺進行 HPLC 分析

HPLC Analysis of Phosphoramidites using RP or NP conditions

亞磷酰胺是寡核苷酸、核苷酸短片段和類似物化學合成的重要組成部分,在合成過程中可能會出現錯誤,因此需要密切監測亞磷酰胺的純度。

在本應用簡報中,說明如何使用兩種不同的分離模式分析亞磷酰胺:反相 (RP) 和正相 (NP) 管柱層析。

此處下載相關應用資料,了解 YMC-Triart 層析管柱如何使用 RP 或 NP 分離模式得到出色的結果。

應用資料:親水性雙肽的快速 HILIC HPLC分析

Fast HILIC analysis of hydrophilic dipeptides

HILIC 分離的沖提順序與 RP 模式完全相反,使其成為分析親水性化合物的理想選擇。由於這些化合物在 HILIC 層析管柱上沖提較晚,因此這種分離模式非常適合分析親水性生物分子。

使用 YMC-Triart SIL 層析管柱可以分離四種不同的親水性雙肽,如此份新應用說明中所示。L-Carnosine和 L-anserine可在哺乳動物的肌肉和腦組織中找到。Gly-Gly 用於胜肽合成而 Gly-Asp 常見於代謝物。

YMC-Triart SIL 層析管柱對所有雙肽均表現出出色的分離度,即使對於結構相似的化合物 L-Carnosine和 L-anserine也是如此。在此處下載應用說明副本,了解如何在 4 分鐘內完成 HILIC 分離!

技術說明:胜肽純化策略白皮書Strategic peptide purification

胜肽(peptides)已成為最重要的生物製藥之一。這些分子的廣泛功能提供了多種藥物的應用。胜肽的化學性質取決於肽鏈的長度、胺基酸側鏈的組成以及分子的潛在二級結構和修飾。

因此,胜肽的大小和物理化學性質可能有很大的不同。這導致生產和製備純化的特殊要求。因此,必須找到最合適的純化策略來解決因此而產生的各種不純物組成。

儘管胜肽分子的生產來源為—合成(synthesis)或重組(recombinant)—藉用逆相層析進行純化是最常使用的,因為可以很容易地分離胜肽的結構變體(structural variants)甚至較小的胜肽中單個胺基酸差異。本文件是在考量經濟效益和生產方面的情形下發表此開發製備型胜肽純化策略指南。這意味著:在成本限制之下於最短循環時間內達到最大的樣品回收率。著重於將毫克級放大到克級產量,而生產規模可達到公斤級甚至噸級產量。製備級LC全面的方法開發通常是以線性放大方法計算,它包括以下步驟:

1.分析級方法開發

2.分析級進樣量測試

3.放大至製備級純化

4.法規事務支援

YMC提供了各種不同材質(C18, C8, C4…等)、粒徑(50~10µm, 7µm…等)、孔徑大小,協助客戶各種不同方法條件篩選,甚至可應用於全水相以及鹼性條件的應用。詳細內容請來信與我們討論或索取原文說明資料。

原文出處:Strategic peptide purification by YMC EUROPE(請來信索取)

相關應用資料:
Peptide純化放大案例應用資料(以Liraglutide為例)(請來信索取)
Application of amino acids/peptide/protein如未列出您所需要分析物,請來信與我們討論取得最新應用!
連續式純化胜肽生產,案例說明tetracosactide,歡迎至我們的客戶BACHEM發佈的youtube影片連結了解詳情(如影片連結失效,請與我們聯繫)。
另有Liraglutide 連續式純化MCSGP應用,請來信與我們討論取得最新應用!

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技術說明:如何進行寡核苷酸(oligonucleotide)分析/純化最佳化?

核酸治療劑,如: 沉默RNA(silencing RNA duplexes, siRNA)、信使 RNA(messenger RNA, mRNA)和反義寡核苷酸(antisense oligonucleotides, ASO)是用於多種疾病的藥物治療極具前景的候選藥物。 治療性寡核苷酸通常經過修飾以增強其穩定性或改善藥代動力學(pharmacokinetics),並可以由骨架(backbone)、鹼基(base)或糖部分的修飾(sugar moieties)以及結構的共軛(conjugatetion)來分類[1]。 通常,寡核苷酸具有磷酸二酯鍵(phosphodiester linkages, PO)。最常見的修飾之一是用硫取代氧原子,從而形成硫代磷酸酯鍵(phosphorothioate linkage, PS)。這種 PS連接可增加對核酸酶的穩定性並防止核酸降解。 PS 寡核苷酸通常用於體內和體外技術,因為它們比 PO 更穩健。

另一個經常進行的修飾是將 2′-ribose位置的親核羥基部分替換為 O-methyl (2′-OMe) 基團。 這進一步增加了對核酸酶降解的穩定性。

 

一、使用離子交換管柱(ion exchange column, IEX)分離寡核苷酸(oligonucleotide)

由於寡核苷酸骨架中帶負電荷的磷酸基團,通常使用陰離子交換 (AEX) 進行分析。 YMC 的無孔陰離子交換管柱 BioPro IEX QF 有一個Quaternary amine殘基作為官能基團。 BioPro IEX QF 的無孔顆粒提供高效率和高解析度的分離效果。

在文章內容中,針對單鏈未修飾和修飾的 DNA 和 RNA進行了不同的最佳化步驟,以凸顯方法效率的重要性。第一組樣品涵蓋具有不同長度(20 和 21 mers)的 PO 鍵的單鏈 DNA 和 RNA,因為 N-1(短鏈)和 N+1(長鏈)是寡核苷酸純化過程中最常見的不純物。 該組樣品還包含具有單個鹼基差異的單鏈 DNA。 第二組樣品處理 PS 鍵連接的單鏈 DNA 和 RNA。藉由改變緩衝溶液的鹽類型和濃度或修改梯度,以減少峰拖尾(peal tailing)和殘留(carryover)。

二、使用離子對-逆相層析(ion-pair reversed-phase HPLC, IP-RP HPLC)分離寡核苷酸(oligonucleotide)

逆相 HPLC 已廣泛用於合成寡核苷酸的分析和純化。由於在一般逆相層析管柱上難以滯留和分離短寡核苷酸等高極性化合物,因此用於這些分離的層析管柱必須有一些特殊性質。包括在 100% 水相中的穩定性、高溫穩定性和更大孔徑等需求。

YMC 提供一系列用於寡核苷酸分析的色譜柱:YMC-Triart C18YMC-Triart Bio C18YMC-Triart C8Hydrosphere C18。 YMC-Triart 系列由於其應用廣泛的膠體設計,可於方法開發中提供更靈活的選擇。而二氧化矽膠體材質的 Hydrosphere C18 對極性化合物具有很強的滯留能力。 對於各種固定相的不同孔徑選擇,也是一個重要因素,因為孔徑會影響寡核苷酸的擴散率,從而影響峰形。

在文章內容中,我們將探討如何提升寡核苷酸於ion-pairing逆相層析中的分離效果。

詳細應用資料內容歡迎來信與我們索取(info@ymctaiwan.com)或與我們進一步討論。

原始文章出處:How to optimize your oligonucleotide analysis from YMC Europe.

Nucleic acids and Oligonucleotides applications分離管柱

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