本文將介紹利用採用兩根色譜柱的連續純化流程「MCSGP-AutoPeak」,對寡核苷酸(ASO)進行高效純化的實例。
不犧牲純度,並將寡核苷酸產量最大化 Maximizing Oligonucleotide Yield Without Sacrificing Purity
1. ASO 純化挑戰
反義寡核苷酸(Antisense Oligonucleotide, ASO)純化需同時兼顧高純度與高產量(Yield)。傳統批次式層析(Batch Chromatography)為達到目標純度,常需捨棄含有產品的Side Fractions,造成產品損失。
2. MCSGP 技術優勢
多管柱逆流溶劑梯度純化(Multicolumn Countercurrent Solvent Gradient Purification, MCSGP)搭配 AutoPeak® 技術,可自動回收並重新純化Side Fractions,在維持產品純度的同時提高產品回收率。
3. CUBE 至 TWIN 製程放大
Contichrom® CUBE 可用於方法開發與製程條件建立,並將 MCSGP 方法進一步轉移至 Contichrom® TWIN,進行製程放大(Scale-up)。
4. 實驗結果
在 Contichrom® TWIN 系統中,傳統批次層析法(Batch)產量為 47.9%,MCSGP 產量提升至 84.3%,約為傳統批次的 1.8 倍;產品純度(Purity)仍維持約 95%。
5. 製程效益
MCSGP 可降低純化過程中的產品損失,提高原料利用率與產品產出,適合應用於反義寡核苷酸(ASO)、寡核苷酸(Oligonucleotide)及胜肽(Peptide)等高價值產品的純化。
本研究以 BioPro IEX SmartSep Q20 resin比較Batch與 MCSGP,主要結果如下:
► 收率提升 1.8 倍:於 Contichrom TWIN 系統進行放大後,MCSGP 將產品產量由 47.9% 提升至 84.3%,同時將產品純度提高至 95.8%。
► 順利進行製程放大(Seamless Scaling):成功將桌上型系統 Contichrom CUBE 所建立的方法,直接轉移至先導性規模/生產規模(Pilot/Production Scale)的 Contichrom TWIN 系統。
► 穩定維持高純度:無論在小規模或先導性規模(pilot-scale)的 MCSGP 操作中,皆可穩定地將原始 DNA 20mer ASO crude由約 72% 的起始純度,純化至最終純度超過 94%。
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